Сельское хозяйство. Согласно законодательным актам Российской империи земли коренного населения были объявлены государственными, что имело большое политическое значение. Российское правительство с первых же дней управления краем практически стало осуществлять функцию верховного собственника земли. Положение 1886 года юридически определяло земельные отношения коренного населения Туркестана, которые отражали сущность земельной политики в Кыргызстане. Хотя земля в целом объявлялась государственной собственностью, все же частично признавались права частного владения землей. Мильковые привилегии (мильк — местная частновладельческая земля) ликвидировались, а вакфные земли (вакф — форма землевладения мусульманского духовенства) продолжали существовать. Предусматривалось и образование нового типа землевладения. Оседлому населению разрешалось продавать и покупать земли, как по местным обычаям, так и по российским порядкам (по крепостям). Право приобретения земельных угодий имели лица, принадлежавшие к русскому подданству, исповедующие христианство, а также местное население. Положение предоставляло кочевому населению землю в наследственное пользование в трех видах: зимовки, летовки и обрабатываемые земли. Отведенные для подкочевья земли и скотопрогонные дороги предоставлялись во всеобщее пользование населения края.
В 1887 году областным правлением были приняты «Правила поземельного устройства в Туркестанском крае» и «Инструкция о правилах введения поземельно-податного устройства в оседлых местностях Туркестана», которая действовала до 1890 года. На 1 января 1910 года земельная реформа в Туркестане, продолжавшаяся 24 года (в Ферганской области — 20 лет), считалась законченной. Что касается кочевых волостей Кыргызстана, то они вплоть до 1917 года оставались незатронутыми реформой.
В Кыргызстане развивалось товарное земледелие. Широкое развитие «торговых» посевов хлеба стало возможным благодаря тесной экономической связи торгового земледелия на окраинах с развитием промышленности в центральных районах России. Одним из основных занятий коренного населения Кыргызстана оставалось скотоводство. В горных местностях, особенно на высокогорье, было выгодно вести подвижное скотоводство, основанное на использовании подножного корма и связанное с меньшими, чем при оседлом образе жизни, затратами труда. Кыргызы разводили овец, коз, лошадей, крупный рогатый скот, а также яков, верблюдов, ослов. Кыргызское скотоводство в основном было экстенсивным. Однако многие новшества (заготовка сена и кормов на зиму, сочетание подножного содержания скота со стойловым и т. п.), начало проникновения в Кыргызстан научной ветеринарии, появление лечебно-ветеринарных пунктов способствовали развитию интенсивного скотоводства.
Социально-экономические изменения, происходившие после присоединения Кыргызстана к России, усилили процесс перехода к оседлости кыргызов. В результате этого к 90-м годам XIX века на юге Кыргызстана появились оседлые поселения — кыштаки. 4 апреля 1898 года впервые в Чуйской долине 33 хозяйства Талкановской волости образовали оседлое селение Таш-Тюбе. Была образована новая Байтиковская оседлая Кыргызская волость, включавшая два селения: Таш- Тюбе и Чала-Казаки в Пишпекском уезде. С 1910 года началось землеустройство Восточно-Сокулукской Кыргызской волости Пишпекского уезда. К январю 1915 года были окончательно оформлены 10 оседлых Кыргызских волостей, в которых было образовано 67 селений с 8267 дворами. В Пржевальском уезде было образовано пять кыргызских селений, которые были причислены к русским волостям. До начала 1916 года землеустройство закончилось еще в четырех волостях Пишпекского уезда.
С присоединением Кыргызстана к России в крае наблюдаются интенсивные социально-экономические изменения.
Так, если до этого торговля носила меновой характер, то теперь происходит переход от меновой, случайной формы торговли к ярмарочно-сезонной, а затем и к постоянной. В Кыргызстане постепенно осуществлялись мероприятия, способствовавшие оживлению местной торговли и промыслов. С 1879 года городским и сельским жителям края было разрешено в базарные дни вести беспошлинную разносную торговлю местными кустарными изделиями. В Ферганской области существовала зякетная система торговли (зякет — определенный торговый сбор с торговой выручки купца). Но в 1885 году она была отменена, и здесь были распространены действовавшие в империи правила. В 1889 году было введено Положение о государственном промысловом налоге, облагавшее всех торговцев, включая и степных, промысловым налогом. По решению Государственного совета от 30 апреля 1884 года в Туркестане, в том числе в Кыргызстане, в течение трех-пяти лет заменялись старые формы и виды клейм, мер и весов на новые, русские. Постепенно изымались из обращения «коканы» и «теньга» (денежные единицы, существовавшие в период Кокандского ханства), были введены русские денежные знаки.
При поощрительной политике русской администрации развивались прогрессивные формы торговли — ярмарочная и стационарная. Самой большой была Аулие-Атинская ярмарка. Ее оборот иногда достигал 4 млн рублей. Важное значение имела также Атбашинская ярмарка, но с открытием Каркаринской ярмарки (1893) оборот Атбашинской ярмарки стал падать. В целях улучшения торгового статуса городов и большего привлечения в них кочевников учреждались ярмарки и в городах. Так, были открыты Пржевальская, Пишпекская и Токмакская городские ярмарки. В первые годы они имели успех. Такие ярмарки не препятствовали развитию стационарной торговли, наоборот, постепенно сливались с ней и превращались в постоянно действующие «торговые точки». Стационарная торговля существовала в оседлых местностях Кыргызстана еще до присоединения края к России — в форме базара. Они устраивались еженедельно, но на базарной площади торги проходили ежедневно. В начале 80-х годов XIX века в городах Ферганской области началось регламентирование работы базаров. В начале XX века центрами торговли стали города Пишпек, Пржевальск, Токмак, Ош, Узген и др. Многие районы юга Кыргызстана тяготели к торгово-промышленным центрам Ферганской области. Важное торговое значение приобрели многие селения как на юге, так и на севере: в 1913— 1914 годы только в 36 населенных пунктах Кыргызстана, исключая города, было около 3 тыс. торговых лавок. В Пишпеке, Пржевальске и Оше существовало соответственно 139, 171 и 1300 торгово-промышленных заведений. Торговые лавки открывались и в горных кочевьях.
Развитие внутренней торговли в Кыргызстане, особенно с начала XX века, способствовало оживленному товарообмену между кочевым и оседлым населением. Сравнительная малочисленность торгово-промышленного, даже земледельческого населения северной части Кыргызстана привела к тому, что скотоводы стали сбывать свои продукты в хлопководческие и промышленные районы юга. Скот и продукты скотоводства туда поставлялись через ярмарки или путем организации перегона через горные перевалы. Так в начале XX века в Кыргызстане зарождалось промышленное скотоводство. В Северном Кыргызстане в торговый оборот поступали и продукты земледелия. Большинство их сбывалось на месте, но определенная часть уходила и за пределы области. Значительная часть в производстве продуктов земледелия приходилась на долю кыргызов.
После 80-х годов XIX века в Ферганской долине расширились посевные площади под техническими культурами (прежде всего, под хлопчатником) и появилось промышленное население. Это обусловило рост потребности оседлого населения в продуктах питания, что повлияло на ускорение процесса оседания кыргызов и увеличение посевных площадей. Таким образом, торговля (особенно в начале XX века) дала сильный толчок к развитию внутреннего рынка в Кыргызстане. Однако следует сказать, что из-за «разделения» Кыргызстана между несколькими областями он оказался в составе двух региональных рынков — Ферганского и Семиреченского, центры которых находились вне территории Кыргызстана. Это обстоятельство затрудняло формирование внутреннего рынка.
В колониальный период мелкотоварное производство в Кыргызстане развивалось медленно.
Постепенно, с развитием капитализма, некоторые виды местных промыслов все более сокращались, часть их, например изготовление бытовых металлических и деревянных изделий, утратила свое былое значение. Теперь потребности кыргызов в этих товарах могли удовлетворяться заводскими изделиями, привозимыми из России. Тем не менее продолжали существовать многие виды домашнего промысла, которые были тесно связаны с кочевым и полукочевым бытом местного населения. Производимые изделия были здесь вне конкуренции с промышленными товарами из России. Поэтому с присоединением края к России наблюдалось даже некоторое развитие таких промыслов. Об этом свидетельствуют данные о количестве ремесленников в Кыргызстане.
С 80-90-х годов XIX века в городах и больших селениях Кыргызстана возникали мелкие предприятия, обрабатывавшие преимущественно сельскохозяйственное сырье. За 30 лет (1883-1913) количество их возросло со 165 до 569. Это были предприятия перерабатывающей, добывающей промышленности, крупные мельницы и т. д. В большинстве случаев они основывались на применении ручного труда. Для многих предприятий кустарной промышленности была характерна сезонность работы.
В начале XX века как в обрабатывающей, так и в добывающей промышленности появились сравнительно крупные капиталистические предприятия. Это было связано с проникновением российского и отчасти иностранного капитала. По своим технико-экономическим показателям они соответствовали капиталистическому предприятию фабрично-заводского типа в центре России. Это хлопкоочистительные заводы в селах Араван и Найман, пивзаводы, кожзаводы и несколько шерстомоек в Пишпеке, Пржевальске и Оше, а так-же крупные рудники по добыче каменного угля и нефтепромыслы на территории Кыргызстана.
Русское правительство стремилось к тому чтобы природные ресурсы края использовали преимущественно русские капиталисты. Тем не менее, некоторые иностранцы-предприниматели и акционеры все же проникали в Туркестан. Обычно это осуществлялось посредством участия иностранного капитала в составе акционерных обществ, созданных в России, или в составе обществ, большинством членов которых были российские подданные. Таким образом, в начале XX века в крае стали активно действовать такие фирмы, как «Правление Андреевского торгово-промышленного товарищества», «Товарищество мануфактур Людвиг Рабенек», Ферганское нефте-горнопромышленное акционерное общество «Чимион», Акционерное общество «Кызыл-Кия» и ряд других.
В 1913 году на территории Кыргызстана находились 32 предприятия различных отраслей: семь каменноугольных копей (занято около 1 тыс. рабочих), два нефтепромысла, два хлопкоочистительных завода, семь шерстомоек, два маслобойных завода, два пивоваренных завода, пять вальцовых мельниц и несколько других предприятий. Из них наиболее крупными были шерстомоечные заводы в Токмаке (100 рабочих) и в Пишпекском уезде (235 рабочих), пивоваренный завод в Оше (84 рабочих), две угольные шахты: в Кызыл-Кии (598 рабочих) и в Сулюкте (207 рабочих).
Если в целом в Туркестанском крае по своим размерам и технико-экономическим показателям доминирующей была обрабатывающая промышленность, то на территории Кыргызстана — горная. Капиталы большинства действовавших в Кыргызстане акционерных обществ (а их здесь было более 10 и обороты их составляли около 10 млн рублей) были вложены в горное дело. На его долю приходилось 50% продукции и 59% рабочих.
Кыргызы некоторое время выплачивали царским властям такие же налоги, как и Кокандскому ханству. Позднее, в соответствии с местными условиями, были выработаны новые механизмы налогообложения. Согласно принятым нормам, занимающиеся кочевым скотоводством кыргызы выплачивали с каждой юрты 2 рубля 75 копеек налога. Так как земля считалась государственным достоянием, за каждую выпасаемую овцу необходимо было платить 3 копейки, за лошадь — 30 копеек, за верблюда — 50 копеек налога. С 1882 года ставка налога повышалась и во время первой мировой войны достигла 15 рублей.
Оседлое население облагалось двумя видами налога. С зерновых площадей взимался харадж, с садовых и овощных — танап. Танап — мера площади, харадж составлял одну десятую урожая и выплачивался натурой. В 1886 году поря¬док взимания танапа был немного изменен. Этот вид налога стал называться оброком и должен был выплачиваться со всей пахотной земли, независимо от того, возделывалась она или нет. Помимо установленных царским правительством налогов местные баи-манапы, опираясь на традиционное патриархально-феодальное право, взимали с простых людей дополнительные подати и выплаты: за выпас скота — чеп ооз, для чествования манапов — чыгым, натурой со скота и зерна — журтчулук, на прокорм — союш, за прогон скота через свою территорию — туяк пул, на свадьбы и поминки — кошумча и др. Служители религии имели свою систему податей. Коррупция в среде местных чиновников стала обыденным явлением.